Широко известна операция ФБР под названием COINTELPRO по подрыву коммунистических движений в США в 1950-х годах, антивоенных движений, движений за гражданские права и права чернокожих. По закону ЦРУ не имело права действовать внутри страны против граждан США. Однако, как утверждается, впервые, президент Линдон Б. Джонсон нарушил закон и поручил тогдашнему руководителю ЦРУ Ричарду Хелмсу активно вмешаться в эту операцию. Журналист The New York Times, лауреат Пулитцеровской премии, Тим Вайнер в своей книге «Наследие из пепла: История ЦРУ» пишет: «В октябре 1967 года во время первого крупного марша в Вашингтоне против войны к протестующим присоединилось несколько аналитиков ЦРУ. Президент рассматривал протестующих как врагов государства. Он был убежден, что движение за мир контролируется и финансируется Москвой и Пекином. Он хотел доказательств и приказал Ричарду Хелмсу найти их. Хелмс напомнил президенту, что ЦРУ было запрещено шпионить за американцами. На что Джонсон ответил: «Я прекрасно это понимаю. То, что я хочу – это чтобы вы занялись этим делом и сделали все необходимое, чтобы выследить иностранных коммунистов, которые стоят за этим нетерпимым вмешательством в наши внутренние дела...» В результате, ЦРУ провело внутреннюю операцию по надзору под кодовым названием «Хаос» продолжительностью почти семь лет. Одиннадцать офицеров ЦРУ стали длинноволосыми хиппи, изучили жаргон «новых левых» и внедрились в протестные группы в США и Европе. По словам Вайнера, агентство составило базу данных из 300 000 имен американских граждан и организаций, а также обширные файлы по 7 200 гражданам. Агентство работало в полной секретности совместно с полицейскими департаментами по всей Америке. ЦРУ шпионило за каждой крупной миротворческой организацией в стране, однако так и не сумело найти их связь с иностранными правительствами.